La historia comienza con Sakura Kinomoto, una pequeña niña que se encuentra persiguiendo a un conejo gigante, el cual es conocido como la carta «The Jump». Una vez que captura la carta, se muestra un recuerdo de como la joven había descubierto un extraño libro en la biblioteca de su padre. Para su sorpresa, cuando Sakura lo abre no hay nada dentro, pero al instante sale la bestia guardiana de las denominadas Cartas Clow, Keroberos, quien le informa a Sakura que dado que las cartas Clow se habían esparcido por todas partes mientras él dormía, su trabajo sería capturarlas, ya que había sido ella quien abrió el libro. Así, la pequeña adquiere poderes mágicos para facilitar la captura de las tarjetas. Durante las clases Sakura se da cuenta de que una de las cartas ronda la escuela, por lo que decide ir tras ella. En la noche logra capturar a la carta «Fly», luego de consolarla porque estaba herida. Días después los alumnos estaban ansiosos por las clases de natación, pero todo toma un giro inesperado cuando escuchan que en la piscina últimamente suceden cosas extrañas, es entonces cuando Sakura y su mejor amiga, Tomoyo investigan si es que es obra de una carta Clow. Al descubrir que sus suposiciones eran correctas, se enfrentan a la carta «Watery» y logran capturarla. Posteriormente, al iniciar las vacaciones de verano descubren que en el estanque del parque del Gran Rey Pingüino aparece un fantasma, pero tras intentar combatirlo Sakura resulta atacada. Luego de recuperarse por completo del ataque, Sakura decide regresar al estanque a vencer a la que después se descubre como la carta «The Illusion»